ไมโครไบโอมหมายถึงจีโนมรวมของจุลินทรีย์ในสภาพแวดล้อมเฉพาะ และไมโครไบโอต้าคือชุมชนของจุลินทรีย์ด้วยกันเอง จุลินทรีย์ประมาณ 100 ล้านล้านตัว (ส่วนใหญ่เป็นแบคทีเรีย แต่รวมถึงไวรัส เชื้อรา และโปรโตซัวด้วย) มีอยู่ในระบบทางเดินอาหารของมนุษย์ไมโครไบโอมในปัจจุบันถือเป็นอวัยวะเสมือนจริงของร่างกาย microbiota จีโนมมนุษย์ประกอบด้วยยีนประมาณ 23,000 ยีน ในขณะที่ไมโครไบโอมเข้ารหัสยีนมากกว่าสามล้านตัวซึ่งผลิตสารเมแทบอไลต์นับพัน ซึ่งแทนที่หน้าที่หลายอย่างของโฮสต์ 13 ซึ่งส่งผลให้ร่างกายแข็งแรง ฟีโนไทป์ และสุขภาพของโฮสต์