คณะกรรมการชุดที่สองถูกจัดตั้งขึ้นในปี พ.ศ. 2509 ตามคำร้องขอของกองทัพอากาศเพื่อตรวจสอบเนื้อหาที่น่าสนใจที่สุดที่รวบรวมโดย Project Blue Book สองปีต่อมา คณะกรรมการชุดนี้ซึ่งทำการศึกษาโดยละเอียดเกี่ยวกับการพบเห็นยูเอฟโอ 59 ครั้ง ได้เผยแพร่ผลการศึกษานี้ในชื่อ Scientific Study of Unidentified Flying Objects หรือที่เรียกว่า Condon Report ซึ่งตั้งชื่อตาม Edward U. Condon นักฟิสิกส์ที่เป็นหัวหน้าการสืบสวน รายงาน Condon ยูเอฟโอ ได้รับการตรวจสอบโดยคณะกรรมการพิเศษของ National Academy of Sciences นักวิทยาศาสตร์ทั้งหมด 37 คนเขียนบทหรือบางส่วนของบทสำหรับรายงาน ซึ่งครอบคลุมการสืบสวนการพบเห็นยูเอฟโอ 59 ครั้งโดยละเอียด เช่นเดียวกับ Robertson Panel คณะกรรมการสรุปว่าไม่มีหลักฐานอื่นใดนอกจากปรากฏการณ์ทั่วไปในรายงาน และยูเอฟโอไม่รับประกันว่าจะมีการสอบสวนเพิ่มเติม สิ่งนี้ประกอบกับกิจกรรมการมองเห็นที่ลดลง นำไปสู่การรื้อ Project Blue Book ในปี 1969