ระยะตัวอ่อนมีระยะเวลาประมาณสัปดาห์ที่สามของการตั้งครรภ์จนถึงสัปดาห์ที่แปดของการตั้งครรภ์ บลาสโตซิสต์เริ่มมีลักษณะเฉพาะของมนุษย์ที่แตกต่างกัน ตอนนี้เรียกว่าตัวอ่อน โครงสร้างและอวัยวะ เช่น ท่อประสาท (ซึ่งต่อมากลายเป็นสมองและไขสันหลัง) ศีรษะ ตา ปาก ทารกในครรภ์ และแขนขา หัวใจของตัวอ่อนเริ่มพัฒนาและเต้นเป็นจังหวะประมาณสัปดาห์ที่หก หน่อที่จะกลายเป็นแขนและขาก็จะเกิดขึ้นประมาณสัปดาห์ที่หก เมื่อสิ้นสุดสัปดาห์ที่แปด อวัยวะและระบบส่วนใหญ่ของเอ็มบริโอจะเริ่มเป็นรูปเป็นร่าง สำหรับคนจำนวนมาก นี่คือจุดเริ่มต้นของการตั้งครรภ์ซึ่งเป็นจุดเริ่มต้นของอาการแพ้ท้อง